Após ser preso e ter que se transferir para uma nova escola em Tokyo, Akira Kurusu recebe o objetivo de reabilitação e é despertado para um novo poder—o poder de um verdadeiro eu, uma Persona. Usando sua Persona e os misterioso app de navegação, Mementos, Akira e seus amigos assumem o papel de Phantom Thieves, salvando as pessoas ao seu redor de seus desejos distorcidos.