Takao Kasuga é um estudante do ensino médio insociável que adora livros; em particular, Les Fleurs du Mal, de Charles Baudelaire. Ele também tem uma queda pelo ídolo de sua classe, a doce Nanako Saeki. Em forte contraste com ela, Sawa Nakamura é uma garota insolente e desagradável que não tem nenhuma preocupação com a escola. Um dia, Takao esquece de levar seu livro para casa. Ele volta à escola para recuperá-lo, mas fica parado quando encontra as roupas de ginástica recém-usadas de Nanako caídas no chão. Um desejo estranho consome Takao e, como um pervertido perverso, ele os rouba. Aku no Hana é uma história convincente de amadurecimento, centrada nos pensamentos, sentimentos e relacionamentos de Takao, enquanto ele tenta viver uma vida normal com a culpa de seu crime que pesa sobre ele.