Tóquio, 2049 ... Graças à Reforma de Galápagos promulgada pelo governo, a Rússia, a China, a América e o Japão estão agora conectados por um sistema Hyper Loop. Essa globalização transformou Tóquio na cidade mais atingida pelo crime do mundo. Para combater o crime crescente, aqueles que trabalham nas sombras desde o período Sengoku são necessários ... Eles são... Os Shinobi!!!