Ichinose Kouta está sendo transferido para a academia dirigida por seu avô. Ele sabe pouco sobre isso, exceto pelo fato de que os alunos são em sua maioria mulheres, então ele imagina que sua vida logo se tornará uma deliciosa história de harém.Quando se perde no caminho para a escola isolada, descobre que há muita coisa que seu avô não lhe contou. A escola é na verdade uma escola só para meninas para ninjas! No início, as meninas acham que ele é um intruso, e ele quase não consegue escapar com vida! Felizmente, o mal-entendido é esclarecido e ele se encontra sob a proteção da bela e mortal presidente do conselho estudantil, Fuyunagi Rindou.Mas mesmo agora, sua vida será tudo menos monótona, já que ele se encontra no meio de um conflito contínuo entre o conselho estudantil de Fuyunagi e ou