Sendo arremessado no mundo de Fate / Extra, Kishinami Hakuno se encontra em uma situação muito estranha. Kishinami Hakuno, estudante, começa a sentir dores e a ouvir vozes vindas de uma estranha marca em sua mão. Na saída da escola ele acha uma garota caída no chão. Seu nome é Matou Sakura. Depois de ajudá-la a ir a enfermaria, indo para casa, um fenômeno estranho acontece deixando o céu totalmente branco e inesperadamente uma face enorme aparece em sua frente! Hakuno está em grande perigo!